RT-01011 鏈cDNA合成試劑盒
產(chǎn)品名稱:RT-01011 鏈cDNA合成試劑盒
產(chǎn)品型號(hào):RT-01011
產(chǎn)品廠商:上海古朵生物科技有限公司
簡(jiǎn)單介紹
RT-01011 鏈cDNA合成試劑盒的詳細(xì)介紹
英文名稱:RT EasyTM(For first-strand cDNA synthesis)
產(chǎn)品規(guī)格:25 rxns 100 rxns
產(chǎn)品貨號(hào):RT-01011
保存說明:短期室溫,長期2-8℃
產(chǎn)品描述:用于長cDNA合成或者客戶特定引物RT反應(yīng)
英文名稱:RT EasyTM(First-strand cDNA for Real Time PCR)
產(chǎn)品規(guī)格:50 rxns 200 rxns
產(chǎn)品貨號(hào):RT-01021
產(chǎn)品描述:鏈合成,添加2種引物,用于Real Time PCR
1、確保RNA完整性及純度。RNA質(zhì)量是決定合成cDNA鏈成功的關(guān)鍵因素,其純度及完整性可由OD260/OD280比值和進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)。較純的RNA樣品OD260/OD280比值通常為1.8-2.0,若該比值偏低,應(yīng)進(jìn)一步純化。真核生物RNA樣品電泳圖譜28s和18s的比值約為2:1,否則,表明有RNA降解。
2、避免RNA酶污染。進(jìn)行cDNA合成所用的器皿、試劑和溶液必須完全無菌。操作過程始終戴手套以杜各種RNA酶的污染。
3、?合成cDNA鏈的引物選擇。選擇oligo(dT)12-18作為反轉(zhuǎn)錄引物,可保證cDNA具有完整的3’-端,通常可得到接近全長的cDNA鏈;若選擇隨機(jī)寡核苷酸(dN)6或(dN)9作為引物,引物在整個(gè)mRNA的多個(gè)位點(diǎn)退火,產(chǎn)生短的部分長度的cDNA鏈。這種方法經(jīng)常用于獲得5’末端序列及從帶有二級(jí)結(jié)構(gòu)區(qū)域或帶有逆轉(zhuǎn)錄酶不能復(fù)制的終止位點(diǎn)的RNA模板獲得cDNA。
鏈cDNA合成試劑盒 操作方法:
1、?逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)
(1)?在無菌薄壁管中加入以下成份:
Total?RNA 0.5-1.0μg
(dN)9?or?oligo(dT)18 100pmol
(2)?混勻后,70℃變性5min,將薄壁管迅速置于冰上冷卻,然后依次加入以下成份:
5×M-MLV?Buffer?????4μl
dNTPs(10mM?each)????1μl
RNasin????????10U
100mM?DTT???????2μl
M-MLV?Reverse?Trans
DEPC-treated?water????up?to?20μl
(3)?混勻后短暫離心,使用oligo(dT)18引物時(shí)在42℃,使用隨機(jī)引物(dN)9時(shí)在37℃下溫育1小時(shí)。
(4)?94℃?5min終止反應(yīng)后,冰上冷卻。
(5)?合成的cDNA鏈可直接用于PCR擴(kuò)增或進(jìn)行其它下游操作。
2、?PCR擴(kuò)增
(1)?在PCR薄壁管中加入以下試劑
Synthesized?cDNA????2-5μl
10×PCR?Buffer?????2μl
Upper?primer?????10pmol
Lower?primer?????10pmol
dNTPs(10mM?each)????0.5μl
Taq?DNA?Polymerase????1.5U
ddH2O???????up?to?20μl
(2)?混勻后短暫離心,然后進(jìn)行PCR擴(kuò)增。
94℃預(yù)變性2.5min。進(jìn)入下列30~40個(gè)循環(huán)(此擴(kuò)增條件僅供參考):94℃30s,60℃?45s,72℃?1min~3min。后72℃延伸7min。
鏈cDNA合成試劑盒 常見問題及參考意見
1、cDNA產(chǎn)量很低,為什么?
可能的原因:(1)RNA模板質(zhì)量低;(2)對(duì)mRNA濃度估計(jì)過高;(3)反應(yīng)體系中存在反轉(zhuǎn)錄酶抑制劑或反轉(zhuǎn)錄酶量不足;(4)反應(yīng)體積過大,一般不應(yīng)超過50μl。
2、合成不了長鏈的cDNA,為什么?
(1)?RNA降解。對(duì)使用的器具、試劑用DEPC、干熱或濕熱滅菌處理,以杜RNase污染。同時(shí),在逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)中加入RNase抑制劑。
(2)?反應(yīng)條件不合適。通過預(yù)實(shí)驗(yàn)確定合適的反應(yīng)條件,包括酶量、鹽濃度、反應(yīng)溫度(37~56℃)、DTT濃度(0.5~10mM)。
(3)?RNA結(jié)構(gòu)問題。提高逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)溫度,或者使用隨機(jī)引物。
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